Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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