Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC26

Slc46a3, Solute carrier family 46 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc46a3Q9DC26 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms