Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY5

Cbx6, Chromobox protein homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx6Q9DBY5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms