Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms