Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAA5

1700016D06Rik, RIKEN cDNA 1700016D06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700016D06RikQ9DAA5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
1700016D06RikQ9DAA5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
1700016D06RikQ9DAA5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
1700016D06RikQ9DAA5 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
1700016D06RikQ9DAA5 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
1700016D06RikQ9DAA5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
1700016D06RikQ9DAA5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
1700016D06RikQ9DAA5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700016D06RikQ9DAA5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700016D06RikQ9DAA5 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700016D06RikQ9DAA5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700016D06RikQ9DAA5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700016D06RikQ9DAA5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700016D06RikQ9DAA5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700016D06RikQ9DAA5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700016D06RikQ9DAA5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700016D06RikQ9DAA5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700016D06RikQ9DAA5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700016D06RikQ9DAA5 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700016D06RikQ9DAA5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700016D06RikQ9DAA5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700016D06RikQ9DAA5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700016D06RikQ9DAA5 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700016D06RikQ9DAA5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700016D06RikQ9DAA5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700016D06RikQ9DAA5 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
1700016D06RikQ9DAA5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700016D06RikQ9DAA5 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700016D06RikQ9DAA5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700016D06RikQ9DAA5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700016D06RikQ9DAA5 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700016D06RikQ9DAA5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700016D06RikQ9DAA5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700016D06RikQ9DAA5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700016D06RikQ9DAA5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700016D06RikQ9DAA5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700016D06RikQ9DAA5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700016D06RikQ9DAA5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700016D06RikQ9DAA5 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700016D06RikQ9DAA5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700016D06RikQ9DAA5 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
1700016D06RikQ9DAA5 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
1700016D06RikQ9DAA5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
1700016D06RikQ9DAA5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18■□□□□ 0.47
1700016D06RikQ9DAA5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700016D06RikQ9DAA5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
1700016D06RikQ9DAA5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700016D06RikQ9DAA5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700016D06RikQ9DAA5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
1700016D06RikQ9DAA5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700016D06RikQ9DAA5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700016D06RikQ9DAA5 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
1700016D06RikQ9DAA5 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700016D06RikQ9DAA5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700016D06RikQ9DAA5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700016D06RikQ9DAA5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700016D06RikQ9DAA5 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700016D06RikQ9DAA5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700016D06RikQ9DAA5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700016D06RikQ9DAA5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700016D06RikQ9DAA5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700016D06RikQ9DAA5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700016D06RikQ9DAA5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
1700016D06RikQ9DAA5 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700016D06RikQ9DAA5 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
1700016D06RikQ9DAA5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700016D06RikQ9DAA5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700016D06RikQ9DAA5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700016D06RikQ9DAA5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700016D06RikQ9DAA5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700016D06RikQ9DAA5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700016D06RikQ9DAA5 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700016D06RikQ9DAA5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700016D06RikQ9DAA5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700016D06RikQ9DAA5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700016D06RikQ9DAA5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700016D06RikQ9DAA5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700016D06RikQ9DAA5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700016D06RikQ9DAA5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700016D06RikQ9DAA5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
1700016D06RikQ9DAA5 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700016D06RikQ9DAA5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700016D06RikQ9DAA5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700016D06RikQ9DAA5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700016D06RikQ9DAA5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700016D06RikQ9DAA5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700016D06RikQ9DAA5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms