Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms