Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Y9

Slx4ip, Protein SLX4IP, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4ipQ9D7Y9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slx4ipQ9D7Y9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slx4ipQ9D7Y9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slx4ipQ9D7Y9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Slx4ipQ9D7Y9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slx4ipQ9D7Y9 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slx4ipQ9D7Y9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slx4ipQ9D7Y9 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slx4ipQ9D7Y9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slx4ipQ9D7Y9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slx4ipQ9D7Y9 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slx4ipQ9D7Y9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slx4ipQ9D7Y9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slx4ipQ9D7Y9 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slx4ipQ9D7Y9 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slx4ipQ9D7Y9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slx4ipQ9D7Y9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slx4ipQ9D7Y9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slx4ipQ9D7Y9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slx4ipQ9D7Y9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slx4ipQ9D7Y9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Slx4ipQ9D7Y9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Slx4ipQ9D7Y9 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Slx4ipQ9D7Y9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Slx4ipQ9D7Y9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Slx4ipQ9D7Y9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Slx4ipQ9D7Y9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Slx4ipQ9D7Y9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Slx4ipQ9D7Y9 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Slx4ipQ9D7Y9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Slx4ipQ9D7Y9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Slx4ipQ9D7Y9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slx4ipQ9D7Y9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slx4ipQ9D7Y9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slx4ipQ9D7Y9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slx4ipQ9D7Y9 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slx4ipQ9D7Y9 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slx4ipQ9D7Y9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slx4ipQ9D7Y9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slx4ipQ9D7Y9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slx4ipQ9D7Y9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slx4ipQ9D7Y9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slx4ipQ9D7Y9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slx4ipQ9D7Y9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slx4ipQ9D7Y9 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Slx4ipQ9D7Y9 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Slx4ipQ9D7Y9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slx4ipQ9D7Y9 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slx4ipQ9D7Y9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slx4ipQ9D7Y9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slx4ipQ9D7Y9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slx4ipQ9D7Y9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slx4ipQ9D7Y9 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slx4ipQ9D7Y9 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slx4ipQ9D7Y9 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slx4ipQ9D7Y9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slx4ipQ9D7Y9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slx4ipQ9D7Y9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slx4ipQ9D7Y9 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slx4ipQ9D7Y9 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slx4ipQ9D7Y9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slx4ipQ9D7Y9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slx4ipQ9D7Y9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slx4ipQ9D7Y9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Slx4ipQ9D7Y9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slx4ipQ9D7Y9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slx4ipQ9D7Y9 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Slx4ipQ9D7Y9 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slx4ipQ9D7Y9 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slx4ipQ9D7Y9 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slx4ipQ9D7Y9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slx4ipQ9D7Y9 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slx4ipQ9D7Y9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slx4ipQ9D7Y9 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Slx4ipQ9D7Y9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Slx4ipQ9D7Y9 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slx4ipQ9D7Y9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slx4ipQ9D7Y9 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slx4ipQ9D7Y9 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slx4ipQ9D7Y9 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slx4ipQ9D7Y9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slx4ipQ9D7Y9 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slx4ipQ9D7Y9 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slx4ipQ9D7Y9 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slx4ipQ9D7Y9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slx4ipQ9D7Y9 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slx4ipQ9D7Y9 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slx4ipQ9D7Y9 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slx4ipQ9D7Y9 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slx4ipQ9D7Y9 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slx4ipQ9D7Y9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slx4ipQ9D7Y9 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slx4ipQ9D7Y9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slx4ipQ9D7Y9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slx4ipQ9D7Y9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slx4ipQ9D7Y9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slx4ipQ9D7Y9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms