Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L5

2310002L09Rik, RIKEN cDNA 2310002L09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2310002L09RikQ9D7L5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
2310002L09RikQ9D7L5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
2310002L09RikQ9D7L5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
2310002L09RikQ9D7L5 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
2310002L09RikQ9D7L5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
2310002L09RikQ9D7L5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
2310002L09RikQ9D7L5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
2310002L09RikQ9D7L5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
2310002L09RikQ9D7L5 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
2310002L09RikQ9D7L5 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
2310002L09RikQ9D7L5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
2310002L09RikQ9D7L5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
2310002L09RikQ9D7L5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
2310002L09RikQ9D7L5 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
2310002L09RikQ9D7L5 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
2310002L09RikQ9D7L5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
2310002L09RikQ9D7L5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
2310002L09RikQ9D7L5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
2310002L09RikQ9D7L5 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
2310002L09RikQ9D7L5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
2310002L09RikQ9D7L5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
2310002L09RikQ9D7L5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
2310002L09RikQ9D7L5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
2310002L09RikQ9D7L5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
2310002L09RikQ9D7L5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
2310002L09RikQ9D7L5 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
2310002L09RikQ9D7L5 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
2310002L09RikQ9D7L5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
2310002L09RikQ9D7L5 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
2310002L09RikQ9D7L5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
2310002L09RikQ9D7L5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
2310002L09RikQ9D7L5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
2310002L09RikQ9D7L5 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
2310002L09RikQ9D7L5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
2310002L09RikQ9D7L5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
2310002L09RikQ9D7L5 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
2310002L09RikQ9D7L5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
2310002L09RikQ9D7L5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
2310002L09RikQ9D7L5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
2310002L09RikQ9D7L5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
2310002L09RikQ9D7L5 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
2310002L09RikQ9D7L5 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
2310002L09RikQ9D7L5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
2310002L09RikQ9D7L5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
2310002L09RikQ9D7L5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
2310002L09RikQ9D7L5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
2310002L09RikQ9D7L5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
2310002L09RikQ9D7L5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
2310002L09RikQ9D7L5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
2310002L09RikQ9D7L5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
2310002L09RikQ9D7L5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
2310002L09RikQ9D7L5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
2310002L09RikQ9D7L5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
2310002L09RikQ9D7L5 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
2310002L09RikQ9D7L5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
2310002L09RikQ9D7L5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
2310002L09RikQ9D7L5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
2310002L09RikQ9D7L5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
2310002L09RikQ9D7L5 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
2310002L09RikQ9D7L5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
2310002L09RikQ9D7L5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
2310002L09RikQ9D7L5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
2310002L09RikQ9D7L5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
2310002L09RikQ9D7L5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
2310002L09RikQ9D7L5 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
2310002L09RikQ9D7L5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
2310002L09RikQ9D7L5 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
2310002L09RikQ9D7L5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
2310002L09RikQ9D7L5 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
2310002L09RikQ9D7L5 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
2310002L09RikQ9D7L5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
2310002L09RikQ9D7L5 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
2310002L09RikQ9D7L5 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
2310002L09RikQ9D7L5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
2310002L09RikQ9D7L5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
2310002L09RikQ9D7L5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
2310002L09RikQ9D7L5 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
2310002L09RikQ9D7L5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
2310002L09RikQ9D7L5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
2310002L09RikQ9D7L5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
2310002L09RikQ9D7L5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
2310002L09RikQ9D7L5 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
2310002L09RikQ9D7L5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
2310002L09RikQ9D7L5 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
2310002L09RikQ9D7L5 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms