Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U0

Lpcat2b, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lpcat2bQ9D5U0 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms