Protein–RNA interactions for Protein: Q9D518

Fam227b, Protein FAM227B, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam227bQ9D518 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms