Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q4

4930578G10Rik, RIKEN cDNA 4930578G10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930578G10RikQ9D4Q4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930578G10RikQ9D4Q4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930578G10RikQ9D4Q4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930578G10RikQ9D4Q4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930578G10RikQ9D4Q4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930578G10RikQ9D4Q4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
4930578G10RikQ9D4Q4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930578G10RikQ9D4Q4 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930578G10RikQ9D4Q4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930578G10RikQ9D4Q4 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930578G10RikQ9D4Q4 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
4930578G10RikQ9D4Q4 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930578G10RikQ9D4Q4 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
4930578G10RikQ9D4Q4 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930578G10RikQ9D4Q4 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930578G10RikQ9D4Q4 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930578G10RikQ9D4Q4 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930578G10RikQ9D4Q4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
4930578G10RikQ9D4Q4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930578G10RikQ9D4Q4 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930578G10RikQ9D4Q4 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930578G10RikQ9D4Q4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
4930578G10RikQ9D4Q4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
4930578G10RikQ9D4Q4 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
4930578G10RikQ9D4Q4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
4930578G10RikQ9D4Q4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
4930578G10RikQ9D4Q4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930578G10RikQ9D4Q4 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930578G10RikQ9D4Q4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930578G10RikQ9D4Q4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930578G10RikQ9D4Q4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930578G10RikQ9D4Q4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930578G10RikQ9D4Q4 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930578G10RikQ9D4Q4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930578G10RikQ9D4Q4 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930578G10RikQ9D4Q4 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930578G10RikQ9D4Q4 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
4930578G10RikQ9D4Q4 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930578G10RikQ9D4Q4 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930578G10RikQ9D4Q4 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930578G10RikQ9D4Q4 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
4930578G10RikQ9D4Q4 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930578G10RikQ9D4Q4 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930578G10RikQ9D4Q4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930578G10RikQ9D4Q4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930578G10RikQ9D4Q4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930578G10RikQ9D4Q4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930578G10RikQ9D4Q4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930578G10RikQ9D4Q4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930578G10RikQ9D4Q4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930578G10RikQ9D4Q4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930578G10RikQ9D4Q4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930578G10RikQ9D4Q4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930578G10RikQ9D4Q4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930578G10RikQ9D4Q4 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930578G10RikQ9D4Q4 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930578G10RikQ9D4Q4 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930578G10RikQ9D4Q4 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930578G10RikQ9D4Q4 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930578G10RikQ9D4Q4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930578G10RikQ9D4Q4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930578G10RikQ9D4Q4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930578G10RikQ9D4Q4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930578G10RikQ9D4Q4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930578G10RikQ9D4Q4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930578G10RikQ9D4Q4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930578G10RikQ9D4Q4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930578G10RikQ9D4Q4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930578G10RikQ9D4Q4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930578G10RikQ9D4Q4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930578G10RikQ9D4Q4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930578G10RikQ9D4Q4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930578G10RikQ9D4Q4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930578G10RikQ9D4Q4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930578G10RikQ9D4Q4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930578G10RikQ9D4Q4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930578G10RikQ9D4Q4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930578G10RikQ9D4Q4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930578G10RikQ9D4Q4 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930578G10RikQ9D4Q4 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
4930578G10RikQ9D4Q4 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930578G10RikQ9D4Q4 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
4930578G10RikQ9D4Q4 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930578G10RikQ9D4Q4 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930578G10RikQ9D4Q4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930578G10RikQ9D4Q4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930578G10RikQ9D4Q4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930578G10RikQ9D4Q4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930578G10RikQ9D4Q4 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930578G10RikQ9D4Q4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms