Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W4

Gpn3, GPN-loop GTPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpn3Q9D3W4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpn3Q9D3W4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpn3Q9D3W4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpn3Q9D3W4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpn3Q9D3W4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpn3Q9D3W4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpn3Q9D3W4 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpn3Q9D3W4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gpn3Q9D3W4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gpn3Q9D3W4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gpn3Q9D3W4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gpn3Q9D3W4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gpn3Q9D3W4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gpn3Q9D3W4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gpn3Q9D3W4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gpn3Q9D3W4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gpn3Q9D3W4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gpn3Q9D3W4 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gpn3Q9D3W4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gpn3Q9D3W4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gpn3Q9D3W4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gpn3Q9D3W4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gpn3Q9D3W4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gpn3Q9D3W4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gpn3Q9D3W4 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gpn3Q9D3W4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gpn3Q9D3W4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gpn3Q9D3W4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gpn3Q9D3W4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms