Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms