Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.9 ms