Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chordc1Q9D1P4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chordc1Q9D1P4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chordc1Q9D1P4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chordc1Q9D1P4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chordc1Q9D1P4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Chordc1Q9D1P4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chordc1Q9D1P4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chordc1Q9D1P4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chordc1Q9D1P4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Chordc1Q9D1P4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chordc1Q9D1P4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chordc1Q9D1P4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chordc1Q9D1P4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chordc1Q9D1P4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chordc1Q9D1P4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chordc1Q9D1P4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chordc1Q9D1P4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chordc1Q9D1P4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chordc1Q9D1P4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chordc1Q9D1P4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chordc1Q9D1P4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chordc1Q9D1P4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chordc1Q9D1P4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chordc1Q9D1P4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chordc1Q9D1P4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chordc1Q9D1P4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chordc1Q9D1P4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chordc1Q9D1P4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chordc1Q9D1P4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chordc1Q9D1P4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chordc1Q9D1P4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chordc1Q9D1P4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chordc1Q9D1P4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chordc1Q9D1P4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chordc1Q9D1P4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chordc1Q9D1P4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chordc1Q9D1P4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chordc1Q9D1P4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chordc1Q9D1P4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chordc1Q9D1P4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Chordc1Q9D1P4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chordc1Q9D1P4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chordc1Q9D1P4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chordc1Q9D1P4 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chordc1Q9D1P4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chordc1Q9D1P4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chordc1Q9D1P4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chordc1Q9D1P4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chordc1Q9D1P4 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chordc1Q9D1P4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chordc1Q9D1P4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chordc1Q9D1P4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chordc1Q9D1P4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chordc1Q9D1P4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chordc1Q9D1P4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chordc1Q9D1P4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chordc1Q9D1P4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chordc1Q9D1P4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chordc1Q9D1P4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chordc1Q9D1P4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chordc1Q9D1P4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chordc1Q9D1P4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chordc1Q9D1P4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chordc1Q9D1P4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chordc1Q9D1P4 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chordc1Q9D1P4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chordc1Q9D1P4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chordc1Q9D1P4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chordc1Q9D1P4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chordc1Q9D1P4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Chordc1Q9D1P4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Chordc1Q9D1P4 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Chordc1Q9D1P4 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Chordc1Q9D1P4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Chordc1Q9D1P4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Chordc1Q9D1P4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Chordc1Q9D1P4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms