Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H6

Ndufaf4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf4Q9D1H6 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufaf4Q9D1H6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufaf4Q9D1H6 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufaf4Q9D1H6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufaf4Q9D1H6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufaf4Q9D1H6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufaf4Q9D1H6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufaf4Q9D1H6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufaf4Q9D1H6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufaf4Q9D1H6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufaf4Q9D1H6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufaf4Q9D1H6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufaf4Q9D1H6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufaf4Q9D1H6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufaf4Q9D1H6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufaf4Q9D1H6 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufaf4Q9D1H6 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufaf4Q9D1H6 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufaf4Q9D1H6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufaf4Q9D1H6 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ndufaf4Q9D1H6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ndufaf4Q9D1H6 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ndufaf4Q9D1H6 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ndufaf4Q9D1H6 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ndufaf4Q9D1H6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ndufaf4Q9D1H6 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ndufaf4Q9D1H6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ndufaf4Q9D1H6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ndufaf4Q9D1H6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ndufaf4Q9D1H6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ndufaf4Q9D1H6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ndufaf4Q9D1H6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms