Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms