Protein–RNA interactions for Protein: Q9D131

UPF0686 protein C11orf1 homolog, mousemouse

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Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D131 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q9D131 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q9D131 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q9D131 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q9D131 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q9D131 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q9D131 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q9D131 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q9D131 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q9D131 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q9D131 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q9D131 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q9D131 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q9D131 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q9D131 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q9D131 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q9D131 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q9D131 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q9D131 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q9D131 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q9D131 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q9D131 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q9D131 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q9D131 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q9D131 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q9D131 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q9D131 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q9D131 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Q9D131 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q9D131 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q9D131 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q9D131 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q9D131 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q9D131 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q9D131 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q9D131 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q9D131 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q9D131 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q9D131 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q9D131 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q9D131 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Q9D131 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Q9D131 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Q9D131 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Q9D131 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D131 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D131 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D131 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D131 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D131 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D131 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D131 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D131 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D131 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D131 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D131 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D131 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D131 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D131 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D131 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D131 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D131 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D131 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D131 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D131 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D131 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D131 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D131 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D131 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D131 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D131 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D131 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D131 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D131 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D131 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D131 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D131 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D131 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D131 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D131 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D131 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D131 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D131 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D131 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D131 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D131 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D131 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D131 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D131 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D131 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D131 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D131 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D131 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D131 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D131 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D131 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D131 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D131 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D131 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D131 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms