Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hddc3Q9D114 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hddc3Q9D114 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Hddc3Q9D114 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hddc3Q9D114 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hddc3Q9D114 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hddc3Q9D114 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hddc3Q9D114 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hddc3Q9D114 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hddc3Q9D114 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hddc3Q9D114 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hddc3Q9D114 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hddc3Q9D114 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hddc3Q9D114 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hddc3Q9D114 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hddc3Q9D114 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hddc3Q9D114 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hddc3Q9D114 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms