Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Y8

Mrpl52, 39S ribosomal protein L52, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl52Q9D0Y8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl52Q9D0Y8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl52Q9D0Y8 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl52Q9D0Y8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl52Q9D0Y8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl52Q9D0Y8 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl52Q9D0Y8 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl52Q9D0Y8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl52Q9D0Y8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl52Q9D0Y8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl52Q9D0Y8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl52Q9D0Y8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl52Q9D0Y8 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl52Q9D0Y8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl52Q9D0Y8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl52Q9D0Y8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl52Q9D0Y8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl52Q9D0Y8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl52Q9D0Y8 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl52Q9D0Y8 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl52Q9D0Y8 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl52Q9D0Y8 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl52Q9D0Y8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl52Q9D0Y8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl52Q9D0Y8 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms