Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms