Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYH6

Rrs1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrs1Q9CYH6 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms