Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX56

Psmd8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd8Q9CX56 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmd8Q9CX56 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmd8Q9CX56 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmd8Q9CX56 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmd8Q9CX56 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmd8Q9CX56 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmd8Q9CX56 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmd8Q9CX56 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmd8Q9CX56 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmd8Q9CX56 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmd8Q9CX56 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmd8Q9CX56 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmd8Q9CX56 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmd8Q9CX56 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmd8Q9CX56 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmd8Q9CX56 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmd8Q9CX56 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmd8Q9CX56 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmd8Q9CX56 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmd8Q9CX56 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmd8Q9CX56 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmd8Q9CX56 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmd8Q9CX56 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmd8Q9CX56 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmd8Q9CX56 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmd8Q9CX56 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmd8Q9CX56 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmd8Q9CX56 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmd8Q9CX56 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmd8Q9CX56 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmd8Q9CX56 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmd8Q9CX56 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmd8Q9CX56 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmd8Q9CX56 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmd8Q9CX56 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmd8Q9CX56 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmd8Q9CX56 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmd8Q9CX56 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmd8Q9CX56 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmd8Q9CX56 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmd8Q9CX56 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmd8Q9CX56 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmd8Q9CX56 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmd8Q9CX56 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms