Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms