Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CWU4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CWU4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CWU4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CWU4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CWU4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CWU4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms