Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms