Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Sycp2Q9CUU3 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Sycp2Q9CUU3 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Sycp2Q9CUU3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Sycp2Q9CUU3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Sycp2Q9CUU3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Sycp2Q9CUU3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Sycp2Q9CUU3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Sycp2Q9CUU3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Sycp2Q9CUU3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Sycp2Q9CUU3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Sycp2Q9CUU3 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
Sycp2Q9CUU3 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
Sycp2Q9CUU3 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Sycp2Q9CUU3 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Sycp2Q9CUU3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Sycp2Q9CUU3 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Sycp2Q9CUU3 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Sycp2Q9CUU3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Sycp2Q9CUU3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Sycp2Q9CUU3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Sycp2Q9CUU3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Sycp2Q9CUU3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Sycp2Q9CUU3 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Sycp2Q9CUU3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Sycp2Q9CUU3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Sycp2Q9CUU3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Sycp2Q9CUU3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Sycp2Q9CUU3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Sycp2Q9CUU3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Sycp2Q9CUU3 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Sycp2Q9CUU3 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Sycp2Q9CUU3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Sycp2Q9CUU3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Sycp2Q9CUU3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Sycp2Q9CUU3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Sycp2Q9CUU3 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Sycp2Q9CUU3 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Sycp2Q9CUU3 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Sycp2Q9CUU3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Sycp2Q9CUU3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Sycp2Q9CUU3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Sycp2Q9CUU3 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Sycp2Q9CUU3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Sycp2Q9CUU3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Sycp2Q9CUU3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Sycp2Q9CUU3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Sycp2Q9CUU3 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Sycp2Q9CUU3 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Sycp2Q9CUU3 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Sycp2Q9CUU3 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Sycp2Q9CUU3 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Sycp2Q9CUU3 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Sycp2Q9CUU3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Sycp2Q9CUU3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Sycp2Q9CUU3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Sycp2Q9CUU3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Sycp2Q9CUU3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Sycp2Q9CUU3 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Sycp2Q9CUU3 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Sycp2Q9CUU3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Sycp2Q9CUU3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Sycp2Q9CUU3 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Sycp2Q9CUU3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Sycp2Q9CUU3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Sycp2Q9CUU3 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Sycp2Q9CUU3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Sycp2Q9CUU3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Sycp2Q9CUU3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Sycp2Q9CUU3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Sycp2Q9CUU3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Sycp2Q9CUU3 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Sycp2Q9CUU3 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Sycp2Q9CUU3 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Sycp2Q9CUU3 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Sycp2Q9CUU3 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Sycp2Q9CUU3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Sycp2Q9CUU3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Sycp2Q9CUU3 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Sycp2Q9CUU3 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Sycp2Q9CUU3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Sycp2Q9CUU3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Sycp2Q9CUU3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Sycp2Q9CUU3 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Sycp2Q9CUU3 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Sycp2Q9CUU3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Sycp2Q9CUU3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Sycp2Q9CUU3 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Sycp2Q9CUU3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Sycp2Q9CUU3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Sycp2Q9CUU3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Sycp2Q9CUU3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Sycp2Q9CUU3 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Sycp2Q9CUU3 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Sycp2Q9CUU3 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Sycp2Q9CUU3 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Sycp2Q9CUU3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Sycp2Q9CUU3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Sycp2Q9CUU3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Sycp2Q9CUU3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms