Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms