Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR29

Ccdc43, Coiled-coil domain-containing protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc43Q9CR29 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms