Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQU3

Rer1, Protein RER1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rer1Q9CQU3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms