Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK7

Rwdd1, RWD domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd1Q9CQK7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rwdd1Q9CQK7 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rwdd1Q9CQK7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rwdd1Q9CQK7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rwdd1Q9CQK7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rwdd1Q9CQK7 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rwdd1Q9CQK7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rwdd1Q9CQK7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rwdd1Q9CQK7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rwdd1Q9CQK7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rwdd1Q9CQK7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rwdd1Q9CQK7 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rwdd1Q9CQK7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rwdd1Q9CQK7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rwdd1Q9CQK7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rwdd1Q9CQK7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms