Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms