Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQB7

Lyrm1, LYR motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lyrm1Q9CQB7 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lyrm1Q9CQB7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lyrm1Q9CQB7 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lyrm1Q9CQB7 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lyrm1Q9CQB7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lyrm1Q9CQB7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lyrm1Q9CQB7 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lyrm1Q9CQB7 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lyrm1Q9CQB7 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lyrm1Q9CQB7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lyrm1Q9CQB7 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lyrm1Q9CQB7 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lyrm1Q9CQB7 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lyrm1Q9CQB7 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lyrm1Q9CQB7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lyrm1Q9CQB7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lyrm1Q9CQB7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lyrm1Q9CQB7 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lyrm1Q9CQB7 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lyrm1Q9CQB7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lyrm1Q9CQB7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lyrm1Q9CQB7 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lyrm1Q9CQB7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lyrm1Q9CQB7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lyrm1Q9CQB7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lyrm1Q9CQB7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lyrm1Q9CQB7 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lyrm1Q9CQB7 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lyrm1Q9CQB7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms