Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ47

4921530L21Rik, RIKEN cDNA 4921530L21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921530L21RikQ9CQ47 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms