Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms