Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rims1Q99NE5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms