Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms