Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms