Protein–RNA interactions for Protein: Q99LM2

Cdk5rap3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap3Q99LM2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk5rap3Q99LM2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms