Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms