Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms