Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q99KU6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q99KU6 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q99KU6 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q99KU6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q99KU6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q99KU6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q99KU6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q99KU6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q99KU6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Q99KU6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q99KU6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Q99KU6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q99KU6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q99KU6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q99KU6 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q99KU6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q99KU6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q99KU6 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q99KU6 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q99KU6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q99KU6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q99KU6 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q99KU6 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q99KU6 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q99KU6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q99KU6 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q99KU6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q99KU6 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q99KU6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q99KU6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q99KU6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q99KU6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Q99KU6 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q99KU6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q99KU6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q99KU6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q99KU6 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Q99KU6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q99KU6 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q99KU6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q99KU6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q99KU6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q99KU6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q99KU6 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q99KU6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q99KU6 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q99KU6 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Q99KU6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q99KU6 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q99KU6 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q99KU6 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q99KU6 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q99KU6 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q99KU6 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q99KU6 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q99KU6 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q99KU6 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q99KU6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q99KU6 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q99KU6 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q99KU6 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q99KU6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Q99KU6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q99KU6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q99KU6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q99KU6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q99KU6 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q99KU6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q99KU6 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q99KU6 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q99KU6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q99KU6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q99KU6 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q99KU6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q99KU6 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q99KU6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q99KU6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q99KU6 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q99KU6 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q99KU6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q99KU6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q99KU6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q99KU6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q99KU6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q99KU6 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q99KU6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q99KU6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q99KU6 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q99KU6 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q99KU6 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q99KU6 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q99KU6 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q99KU6 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q99KU6 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q99KU6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q99KU6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q99KU6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q99KU6 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q99KU6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms