Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms