Protein–RNA interactions for Protein: Q924N9

Prss28, Serine protease 28, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss28Q924N9 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms