Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.6 ms