Protein–RNA interactions for Protein: Q922D8

Mthfd1, C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mthfd1Q922D8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mthfd1Q922D8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Mthfd1Q922D8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mthfd1Q922D8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mthfd1Q922D8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mthfd1Q922D8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mthfd1Q922D8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Mthfd1Q922D8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mthfd1Q922D8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mthfd1Q922D8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mthfd1Q922D8 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mthfd1Q922D8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mthfd1Q922D8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mthfd1Q922D8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mthfd1Q922D8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mthfd1Q922D8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mthfd1Q922D8 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mthfd1Q922D8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mthfd1Q922D8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mthfd1Q922D8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mthfd1Q922D8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mthfd1Q922D8 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mthfd1Q922D8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Mthfd1Q922D8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mthfd1Q922D8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mthfd1Q922D8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mthfd1Q922D8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mthfd1Q922D8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mthfd1Q922D8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mthfd1Q922D8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mthfd1Q922D8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mthfd1Q922D8 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Mthfd1Q922D8 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mthfd1Q922D8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mthfd1Q922D8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mthfd1Q922D8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mthfd1Q922D8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mthfd1Q922D8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Mthfd1Q922D8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mthfd1Q922D8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mthfd1Q922D8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mthfd1Q922D8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mthfd1Q922D8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mthfd1Q922D8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Mthfd1Q922D8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Mthfd1Q922D8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Mthfd1Q922D8 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Mthfd1Q922D8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mthfd1Q922D8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mthfd1Q922D8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mthfd1Q922D8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mthfd1Q922D8 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mthfd1Q922D8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mthfd1Q922D8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mthfd1Q922D8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mthfd1Q922D8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mthfd1Q922D8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mthfd1Q922D8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mthfd1Q922D8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mthfd1Q922D8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mthfd1Q922D8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mthfd1Q922D8 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Mthfd1Q922D8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mthfd1Q922D8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mthfd1Q922D8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mthfd1Q922D8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mthfd1Q922D8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mthfd1Q922D8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mthfd1Q922D8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mthfd1Q922D8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mthfd1Q922D8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mthfd1Q922D8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mthfd1Q922D8 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mthfd1Q922D8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mthfd1Q922D8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mthfd1Q922D8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mthfd1Q922D8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mthfd1Q922D8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mthfd1Q922D8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mthfd1Q922D8 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Mthfd1Q922D8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mthfd1Q922D8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mthfd1Q922D8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mthfd1Q922D8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mthfd1Q922D8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mthfd1Q922D8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mthfd1Q922D8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mthfd1Q922D8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mthfd1Q922D8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mthfd1Q922D8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mthfd1Q922D8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mthfd1Q922D8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mthfd1Q922D8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mthfd1Q922D8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mthfd1Q922D8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mthfd1Q922D8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mthfd1Q922D8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Mthfd1Q922D8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mthfd1Q922D8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mthfd1Q922D8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms