Protein–RNA interactions for Protein: Q91WL6

Snx11, Sorting nexin-11, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx11Q91WL6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx11Q91WL6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx11Q91WL6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms