Protein–RNA interactions for Protein: Q91WG3

Trub2, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Trub2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trub2Q91WG3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trub2Q91WG3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms