Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE1

Snx15, Sorting nexin-15, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx15Q91WE1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms