Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms